PCR實(shí)驗(yàn)室布局原則上設(shè)計(jì)為試劑準(zhǔn)備區(qū)、樣品制備區(qū)、擴(kuò)增區(qū)和擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)四個(gè)單獨(dú)的工作區(qū)域并設(shè)有專用走廊，各工作區(qū)域應(yīng)設(shè)緩沖間，工作區(qū)與緩沖間宜安裝連鎖裝置。不同功能的工作區(qū)應(yīng)是分隔獨(dú)立的，各工作區(qū)有明顯的標(biāo)志，不能直通，如果緊密相連，需安裝物品傳遞窗。

　　前兩區(qū)為擴(kuò)增前區(qū)，后兩區(qū)為擴(kuò)增后區(qū)，擴(kuò)增前區(qū)與擴(kuò)增后區(qū)應(yīng)嚴(yán)格分開。物品只能從擴(kuò)增前區(qū)流向擴(kuò)增后區(qū)，即從試劑準(zhǔn)備區(qū)、樣品制備區(qū)到擴(kuò)增區(qū)和擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)，不得逆向流動(dòng)。實(shí)驗(yàn)室的氣流也應(yīng)從擴(kuò)增前區(qū)流向擴(kuò)增后區(qū)，不得逆向流動(dòng)。

　　四大區(qū)域應(yīng)形成單向流線、宜采用全送全排。

　　各區(qū)域之間設(shè)計(jì)應(yīng)具備單向的實(shí)驗(yàn)工藝流、物流、人流與氣流，形成單向流程的保護(hù)屏障，避免實(shí)驗(yàn)之間的相互干擾，防止氣溶膠擴(kuò)散對(duì)實(shí)驗(yàn)過程造成污染。

　　PCR實(shí)驗(yàn)室并沒有嚴(yán)格的凈化要求，但是為避免各個(gè)實(shí)驗(yàn)區(qū)域交叉污染的可能性，宜采用全送全排的氣流組織形式，嚴(yán)格控制送、排風(fēng)的比例以保證各實(shí)驗(yàn)區(qū)壓力要求。

　　另外，PCR實(shí)驗(yàn)室內(nèi)通常有生物安全柜、通風(fēng)柜等生產(chǎn)設(shè)備，這類設(shè)備排風(fēng)量大且使用時(shí)間有間隔性，并不與空調(diào)系統(tǒng)運(yùn)行時(shí)間一致，這就導(dǎo)致有這些設(shè)備的房間在設(shè)備啟停的時(shí)候很容易失壓，原本正常的壓力梯度瞬間就破壞了。這正是PCR實(shí)驗(yàn)室空調(diào)系統(tǒng)設(shè)計(jì)的難點(diǎn)所在。